据外媒报道，日本有一个叫做Iwantani的能源机构准备建设供氢加油站，但是该修建工程不仅费时成本也高。据了解，日本政府将氢定义为一种工业气体，所以充电站建完后需符合所有的安全标准，要知道这些标准都是很严格的。从而这就导致单一个充电站的成本便达到5亿日元（大约是450万美元）。据美国金融时报报道，同样的一个供氢充电站，在日本的成本是美国的两倍多。目前，日本政府已意识到充电站的高成本问题，表示将采取相对应的措施，在2025年之前将其成本降低。此外，日本总理安倍晋三承诺，日本将建设一条面向国际的氢供应链，该条链将包括从产品到运输再到消费。日本政府的干涉是必要的，因为在技术推广之前，几乎没有私企愿意冒险投资氢充电站，而且在基础设施改善之前，基本上也没有司机愿意选择驾驶氢燃料汽车，毕竟氢燃料汽车不像混合式汽车那样，燃油效率高于普通汽车而驾驶体验又与普通汽车没多大差别，不会给司机带来过多不必要的困扰。
其次，氢的来源是另一个重要的问题，要知道地球上并没有天然的纯氢，这就导致氢的成本很高并且产氢过程的能源消耗很高。尽管Iwantani目前通过燃烧天然气成功地解决了这个问题，与此同时，澳大利亚政府正在尝试通过燃烧褐煤来生产大量的氢气，如果这个尝试取得成功，澳大利亚将向日本这样的国家出口褐煤。当我们目前还不清楚，当氢燃料在充电站出售时，其每公里行程耗量的售价是否会比汽油有竞争力。据外媒报道，美国一家报社在两周以前曾做过一个实验，其为一辆现代Clarity燃料汽车加了20美元的燃料，最后该车的行驶距离大概是60到75英里（1英里(mi)=1.609344公里(km)）。
最后，目前发展和建设氢燃料供能系统的成本仍是很高的，丰田Mirai的氢储存箱材料使用的是碳素纤维，并且该车的车载燃料电池是利用铂来产电。无疑高额成本最终将由消费者来承担，这也就是为什么Mirai的起售价高达5.7万美元的原因，因此，在氢燃料推广之前，氢燃料电池汽车的成本也需要大幅降低。目前，丰田公司依然很看好氢燃料电池汽车的发展前景，该公司表示，希望氢燃料汽车的年销售量在2020年以前达到30000辆，这数字是丰田公司今年销售目标量的10倍。此外，该公司领导层希望，其生产的氢燃料汽车和巴士能在东京举办2020年奥林匹克运动会时用来输送运动员和其他重要来宾，在这样一个引人注目的国际赛事中得到大量的曝光将有利于丰田氢燃料汽车的推广。但如果丰田要让Prius获得成功，其需要赶快采取合适的方法解决氢燃料汽车发展面临的所有难题。
